Metoda počítání na plotnách však může měřit pouze ty kultivovatelné mikroorganismy, které často podhodnocují skutečný počet mikroorganismů v půdě, a existuje mnoho interferenčních faktorů, jako je shlukování původních bakterií v půdní suspenzi nebo přichycení k půdě. Na peletách je počet kolonií vytvořených na misce nižší než skutečný počet kolonií; použité médium nebo kultivační podmínky jsou selektivní, je obtížné rozlišit všechny mikroorganismy stejně a ředění může inhibovat určité typy (druhy). ) Mikroorganismy. Aby bylo možné přesněji popsat výsledky počítání kolonií na plotně, je nyní nakloněno použití jednotek tvořících kolonie k vyjádření počtu mikroorganismů ve vzorku.
